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PCR-SSCP几个重要的因素进行探讨

 

      聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)是一种快速、简便、较灵敏的检测基因变异的方法,但其影响因素很多,本文对凝胶浓度、上样量、PCR产物稀释倍数、甘油浓度、电压、电泳温度几个重要的因素进行探讨.。其基本原理是对已知有基因点突变的遗传病,在其突变位点附近设计引物进行PCR扩增,将扩增的产物取出一部分(一般为1pl),变性后在不含变性剂的中性聚丙烯酰胺凝胶中电泳,由于单链DNA中碱基配对或聚集,当温度或变性剂等环境改变会引起不同的构象

方法:通过应用PCR-SSCP方法结合核苷酸序列分析检测成都汉族群体98个个体人类补体第8成分(C8A)基因型频率分布.结果:凝胶浓度为8%,PCR产物稀释4倍,上样量为4μl,不加甘油,电压为200V,恒温电泳时,SSCP分析可得到满意的结果.结论:PCR-SSCP分析对不同的研究对象,其分析参数不同,需要对其分析条件进行最大优化,才能获得实验的成功.