1、平板划线分离法：把混杂在一起的微生物或同一微生物群体中的不同细胞用接种环圈在平板培养基表面，通过分区划线稀释而得到较多独立分布的单个细胞，经培养后生长繁殖成单菌落。
2、稀释涂布平板法将菌液进行一系列的梯度稀释，然后将不同稀释度的菌液分别涂布到琼脂固体培养基的表面进行培养，在稀释度足够高的菌液里，聚集在一起的微生物将被分散成单个细胞，从而能在培养基表面形成单个菌落。
上述两种方法虽然都可以实现观察菌落特征的目的，但平板划线分离法不能对菌落计数，而稀释涂布平板法培养过程复杂，对平板的要求比较高，可参照以下步骤：
a、制备平板培养基将氯化钠蔗糖琼脂培养基加热溶化并冷却至65℃，向氯化钠蔗糖琼脂培养基中加入克林霉素溶液3～5ml并混合均匀，然后取20ml混合均匀的培养基溶液倒入培养皿，轻轻摇动培养皿，使培养基溶液均匀分布在培养皿底部，待培养基溶液凝固后即得平板培养基。
b、制备活性污泥混合液称取活性污泥土样15g，放入盛100ml无菌水并带有玻璃珠的三角烧瓶中，振摇15～20min混合均匀，用一支1ml无菌吸管从中吸取1ml土壤悬液加入盛有9ml无菌水的大试管中充分混匀，制成活性污泥混合液。
c、培养基涂布从活性污泥混合液中吸取0.2ml，滴在平板培养基表面的中央位置，用无菌玻璃涂棒将活性污泥混合液沿同心圆方向轻轻地向外扩展，使之分布均匀。
荚膜红细菌 ATCC 11166
粪产碱菌 ATCC 8750
大肠埃希氏菌 ATCC 25922
金黄色葡萄球菌金黄色亚种 ATCC 25923
铜绿假单胞菌 ATCC 27853
大肠埃希氏菌 ATCC 8739
铜绿假单胞菌 ATCC 9027
金黄色葡萄球菌金黄色亚种 ATCC 6538
枯草芽孢杆菌 ATCC 6633
地衣芽孢杆菌 ATCC 11946
潮湿纤维单胞菌 ATCC 491
铜绿假单胞菌 ATCC 9027
大肠杆菌 ATCC 8739
恶臭假单胞菌 ATCC 17485
白色假丝酵母 ATCC 10231
扣囊内孢霉 ATCC 36213
马克斯克鲁维酵母 ATCC 36534
白色假丝酵母 ATCC 10231
白色假丝酵母 ATCC 10231
黑曲霉 ATCC 16404
蛎灰链霉菌 DSM 40511、ATCC 27455
停乳链球菌 ATCC 35666
大豆根瘤菌 ACCC 15067
产朊假丝酵母 ATCC 22023
砖红链霉菌 ATCC 19776
